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我國科研人員開發(fā)檢驗基因表達“開關”可靠性的數據庫

發(fā)布時間:2025年12月03日20:33 來源: 新華社

新華社南京12月3日電(記者陳席元)RNA甲基化修飾被認為是控制基因表達的“開關”,但長期以來,該領域研究中有關基因位點是否有修飾的實驗結果并不穩(wěn)定。

記者3日從位于江蘇蘇州的西交利物浦大學獲悉,該校助理教授魏震團隊綜合近1400種研究數據,開發(fā)可交叉驗證的RNA甲基化修飾位點數據庫,為今后評價相關實驗結論是否可靠提供參考。研究成果3日發(fā)表在國際學術期刊《核酸研究》上,并向全球免費開放。

魏震介紹,RNA甲基化修飾能控制基因的表達,被認為與多種疾病密切相關,也是近年來國內外生物學研究的熱點。

然而,該領域長期面臨一大難題,同一個基因、同一處位點,采用不同的檢測方法,會得到大相徑庭的檢測結果。

“這篇論文認為某位點有修飾,那篇論文認為沒有修飾,令后來的研究者無所適從,只能重新測一遍,造成重復勞動和資源浪費?!蔽赫鹫f。

團隊想到,可以用統計學方法回顧已有研究,檢驗各類實驗結果的可靠性。

魏震告訴記者,過去兩年里,團隊重點收集了東亞、北美、歐洲三大公共數據庫1393個生物學樣本的原始測序數據,覆蓋了10種常用的RNA甲基化修飾檢測技術。

通過“正交驗證”算法,團隊識別出13.5萬個高置信度RNA甲基化修飾位點,建成標準統一、直接可比的數據庫,目前已有24個國家的科研人員使用。

“這個數據庫將幫助科研人員區(qū)分實驗中出現的信號,哪些是可靠的生物學標記,哪些只是實驗噪音?!蔽赫鸨硎荆芯恐袌F隊還發(fā)現6000多個基因變異,其中有些變異與抑郁癥等復雜疾病的RNA甲基化修飾位點呈現高度相關性,有望為科學家探究疾病的分子機制提供新角度。

【責任編輯:肖夢吟】